Virtual screening based on molecular docking of lysosomotropic compounds as therapeutic agents for COVID-19

Autores/as

  • João Batista de Andrade Neto Federal University of Ceará http://orcid.org/0000-0002-3180-3012
  • Emanuelle Machado Marinho Federal University of Ceará
  • Cecília Rocha da Silva Federal University of Ceará,
  • Lívia Gurgel do Amaral Valente Sá Christus University Center (UNICHRISTUS) http://orcid.org/0000-0002-0619-2782
  • Vitória Pessoa de Farias Cabral Federal University of Ceará http://orcid.org/0000-0002-6408-7200
  • Thiago Mesquita Cândido Federal University of Ceará
  • Wildson Max Barbosa da Silva Christus University Center (UNICHRISTUS)
  • Letícia Bernardo Barbosa Christus University Center (UNICHRISTUS) http://orcid.org/0000-0003-0276-711X
  • Bruno Coelho Cavalcanti Federal University of Ceará, Fortaleza
  • Pedro de Lima Neto Department of Analytical Chemistry and Physical Chemistry, Group of Theoretical Chemistry
  • Emmanuel Silva Marinho State University of Ceará http://orcid.org/0000-0002-4774-8775
  • Akenaton Onassis Cardoso Viana Gomes Federal University of Ceará
  • Hélio Vitoriano Nobre Júnior Federal University of Ceará

DOI:

https://doi.org/10.12662/2317-3076jhbs.v10i1.4238.p1-12.2022

Palabras clave:

Lysosomotropic agents, SARS-CoV, Molecular Docking

Resumen

Objective: Analyze lysosomotropic agents and their action on COVID-19 targets using the molecular docking technique. Methods: Molecular docking analyses of these lysosomotropic agents were performed, namely of fluoxetine, imipramine, chloroquine, verapamil, tamoxifen, amitriptyline, and chlorpromazine against important targets for the pathogenesis of SARS-CoV-2. Results: The results revealed that the inhibitors bind to distinct regions of Mpro COVID-19, with variations in RMSD values from 1.325 to 1.962 Å and binding free energy of -5.2 to -4.3 kcal/mol. Furthermore, the analysis of the second target showed that all inhibitors bonded at the same site as the enzyme, and the interaction resulted in an RMSD variation of 0.735 to 1.562 Å and binding free energy ranging from -6.0 to -8.7 kcal/mol. Conclusion: Therefore, this study allows proposing the use of these lysosomotropic compounds. However, these computer simulations are just an initial step toward conceiving new projects for the development of antiviral molecules.

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Descargas

Publicado

2022-06-30

Cómo citar

1.
de Andrade Neto JB, Marinho EM, da Silva CR, Valente Sá LG do A, Cabral VP de F, Cândido TM, et al. Virtual screening based on molecular docking of lysosomotropic compounds as therapeutic agents for COVID-19. J Health Biol Sci. [Internet]. 30 de junio de 2022 [citado 23 de diciembre de 2024];10(1):1-12. Disponible en: https://unichristus.emnuvens.com.br/jhbs/article/view/4238

Número

Vol. 10 Núm. 1 (2022): Journal of Health and Biological Sciences

Sección

ARTÍCULOS ORIGINALES

Licencia

Autores que publican en esta revista acepta los siguientes términos:

  1. Autores retienen el copyright y otorguen el diario el derecho de la primera publicación, con el trabajo simultáneamente licenciado bajo la licencia Creative Commons que permite compartir el trabajo con reconocimiento de autoría y publicación inicial en este diario.
  2. Permite que los autores asumir contratos adicionales por separado, para su distribución no exclusiva de la obra publicada en esta versión de diario (ej.: publicar en Repositorio institucional o como un capítulo del libro), con el reconocimiento de autoría y publicación inicial en este diario.
  3. Autores se permite y se anima a publicar y distribuir su trabajo en línea (por ejemplo, en repositorios institucionales o en tu página personal) en cualquier momento antes o durante el proceso editorial, ya que esto puede generar cambios productivos, así como aumentar el impacto y la citación de trabajos publicados (ver el efecto del acceso abierto).